Tsubomi, jeune fille timide et réservée, est obligée de déménager. Ses parents sont fleuristes de ce fait elle adore les fleurs. Dans sa nouvelle école elle se fait rapidement une amie, Erika. Mais un jour, Tsubomi rêve de Cure Moonlight et de l'Arbre des Coeurs en danger à cause des apôtres du désert. Le lendemain, deux petites fée, Shypre et Coffret, lui annonce qu'elle sera une Precure. C'est après avoir sauvé Erika d'un désertorien qu'elle devient a son tour une Precure !! C'est le début d'une bataille pour éviter que le monde ne devienne un désert...