En 2024, Sora Yûki est une collégienne de quatorze ans assez solitaire, puisqu’elle est la seule parmi son entourage à ne pas jouer à The World, un jeu de rôle en ligne très populaire dans le monde entier. Avec un petit coup de pouce de ses amis, de Kakeru Tanaka, notamment, Sora décide de franchir le pas et s’essaye à The World, sa première expérience s’avére particulière puisqu’elle y rencontre une femme mystérieuse, qui lui donne un objet inconnu, et s’ensuit une attaque de ce qui semble être un virus s’en prenant au système de ce jeu en ligne. Ce film est censé apporté la conclusion au Projet .Hack. Ordre chronologique des différents animes du Projet .Hack., du plus ancien au plus récent : Sign / Liminality / Legend of Twilight / Roots / Quantum / Terminal Disk / Sekai no Mukou ni.