En L.C. 922, ce monde se retrouve toutefois confronté à un grand danger : après des années de conflit, la terre divine Tetra Heaven, semble enfin retrouver la paix. Malheureusement, les divinités vaincus se tournent vers le monde des hommes, Septpia, et décident de s'y installer. Un groupe composé de Logicalist est alors formé pour lutter contre cette invasion. Tsurugi Yoshichika, un jeune civil manquant singulièrement de "logique", va croiser la route d'Athena à l'occasion de ce nouveau conflit. Elle va alors lui offrir ce qui lui manque et lui permettre de prendre son destin en main.