Pour des raisons familiales, Yû Narukami, jeune lycéen, est envoyé vivre chez son oncle dans la ville d’Inaba. Faisant la connaissance, dans son établissement, de Chie Satonaka et Yôsuke Hanamura, il entend parler du « Midnight Channel », une rumeur étrange selon laquelle regarder la télévision à minuit très exactement, alors que la nuit est pluvieuse, permet de voir son âme sœur à l’écran. Incrédules dans un premier temps, les trois adolescents vont se retrouver projeter à travers une télévision dans un monde parallèle. À l’intérieur de celui-ci, il ne leur faudra que peu de temps pour comprendre que cet univers étrange est à l’origine des morts inexpliquées ayant lieu dans leur ville. En effet, chaque individu qui y pénètre se retrouve confronté à une image refoulée de lui-même cherchant à l’éliminer. Conscients des enjeux, Yû et ses camarades utiliseront alors des Persona, sortes de gardiens capables d’anéantir ses démons, afin de mettre un terme à cette folie meurtrière.