C'est l'histoire de Yomiko Readman, une fille peu ordinaire qui a le pouvoir de manipuler le papier et qui est obnubilée par les livres : son appartement en est rempli. Elle achète un vieux livre d'une collection de 3 tomes dans une étrange boutique qui va la mener dans un combat contre des génies aux pouvoirs impressionnants. Elle est contactée par la British Library qui l'aidera dans sa tâche grâce à deux agents : une mystérieuse Miss Deep et un militaire à la retraite.