Échoué sur une plage, Takuto Tsunashi est secouru par Wako Agemaki et Sugata Shindô alors qu’il est encore inconscient. Hébergé chez Sugata, il apprend à son réveil que ses deux sauveurs sont fiancés et que Wako est l’une des quatre prêtresses de l’île où il s’apprête à faire ses études. Informé lors de la réunion des nouveaux élèves de l’interdiction d’approcher la mine abandonnée, il passe outre et se heurte à l’organisation de la Croix-Étoilée, dont les membres viennent de séquestrer Wako avec l’intention de se servir d’elle pour poursuivre l’activation des Cybodies (marionnettes masquées pouvant se transformer en géantes entités robotiques), nécessaires pour accéder à un espace dimensionnel, figé dans le temps. Mais comment Takuto a-t-il pu suivre le Cybody ennemi dans cet espace, sans équipement, et quelle est cette lumière blanche qui s’échappe de son torse ?